Водни костенурки са склонни към няколко често срещани заболявания , особено ако си диета или местообитание не се държи като подобно на това, което щеше да е естествената им среда . Костенурки изискват много физически мерки за предотвратяване на растежа на микроорганизми , които причиняват заболяване . Ако една костенурка е болен , той трябва да бъде изолиран от другите костенурки и евентуално третирани от ветеринар . SCUD
Септична кожен улцерозен болест , или Скъд е бактериално заболяване , което се среща често при водните костенурки . Костенурката ще имат язви по кожата на различни места по тялото му. Бактериите Citrobacter обикновено присъства във водата и трябва да се лекува.
Ненормални Tomium
Водни костенурки може да се развие един обрасъл клюн , известен също като tomium , причинени от яденето неестествени храни. Когато костенурка се хранят неправилно, тя може да се развие болестта ненормално tomium . Промяна на диетата си и смилане по твърде дълъг клюн с дремел инструмент може да го отстрани .